教师简介

姓名：	陈凤玲
性别：	女
系别：	动物学与动物生理学系
职称：	青年研究员
学位：	博士

陈凤玲 博士，青年研究员，博士生导师。2020年博士毕业于清华大学自动化系，2020-2024年在清华大学生命学院进行博士后研究。2024年入选中国农业大学人才引进计划，任生物学院动物学与动物生理学系青年研究员。聚焦于利用单细胞/空间组学、遗传学、生物信息学手段研究早期胚胎转录调控与体外模拟。截止目前，已在Nature，Nature Communications, Nucleic acids research等期刊上以第一/共同第一作者身份发表多篇论文。

学习与工作经历

2024.11-至今    中国农业大学　　　　生物学院   　　　　　　青年研究员

2020.09-2024.09  清华大学　　　　　　生命科学学院　　　　　　博士后

2019.06-2019.12  斯坦福大学　　　　　统计系　　　　　　　　　访问学者

2015.09-2020.07  清华大学　　　　　　自动化系　　　　　　　　博士

2011.09-2015.07  北京航空航天大学　　电子信息工程学院　　　　学士

研究方向

1、开发机器学习和统计建模方法解析生命组学数据。

2、解析早期胚胎转录调控网络与细胞命运决定机制。

3、解析早期胚胎与干细胞三维基因组调控机制与功能。

实验室主页：https://chenfengling.github.io/
诚挚欢迎感兴趣的本科生、研究生、博士后加入实验室一起合作学习！

联系方式

邮　　件：cfl24 at cau.edu.cn

通讯地址：北京市海淀区圆明园西路2号，九州·体育，100193

发表文章  (# Co-First Author)

1. Ji, S.#, Chen, F.#, Stein, P.#, Wang, J.#, Zhou, Z.#, Wang, L.#, ... & Xie, W. (2023). OBOX regulates murine zygotic genome activation and early development. Nature. 2023 Aug;620(7976):1047-1053.

2. Nie, X.#, Xu, Q.#, Xu, C.#, Chen, F.#, Wang, Q., Qin, D., … & Li, L. (2023). Maternal TDP-43 interacts with RNA Pol II and regulates zygotic genome activation. Nature communications, 14(1), 4275.

3. Wang, R.#, Chen, F.#, Chen, Q.#, Wan, X.#, Shi, M., Chen, A. K., ... & Zhu, D. (2022). MyoD is a 3D genome structure organizer for muscle cell identity. Nature communications, 13(1), 1-17. (IF: 17.694)

4. Yang, L.#, Chen, F.#, Zhu, H.#, Chen, Y., Dong, B., Shi, M., ... & Wu, H. (2021). 3D genome alterations associated with dysregulated HOXA13 expression in high-risk T-lineage acute lymphoblastic leukemia. Nature communications, 12(1), 3708.

5. Chen, F.#, Li, G.#, Zhang, M. Q., & Chen, Y. (2018). HiCDB: a sensitive and robust method for detecting contact domain boundaries. Nucleic acids research, 46(21), 11239-11250.

6. Du, Z.#, Hu, L.#, Zou, Z.#, Liu, M.#, Li, Z., Lu, X., Harris, C., Xiang, Y., Chen, F., ... & Xie, W. (2024). Stepwise de novo establishment of inactive X chromosome architecture in early development. Nature Genetics, 1-14.

7. Li, L.#, Lai, F.#, Hu, X.#, Liu, B.#, …, Chen, F., Fan, Q., Ralston, A., & Xie, W. (2023). Multifaceted SOX2-chromatin interaction underpins pluripotency progression in early embryos. Science, 382(6676).

8. Guo, T.#, Yuan, Z.#, Pan, Y., Wang, J., Chen, F., Zhang, M. Q. & Li, X. (2023). SPIRAL: integrating and aligning spatially resolved transcriptomics data across different experiments, conditions, and technologies. Genome biology, 24(1), 241. (IF: 12.3)

9. Ye, Z., Chen, F., Zeng, J., Gao, J., & Zhang, M. Q. (2021). ScaffComb: A Phenotype‐Based Framework for Drug Combination Virtual Screening in Large‐Scale Chemical Datasets. Advanced Science, 8(24), 2102092. (IF: 17.521)

10. Li, Y., He, Y., Liang, Z., Wang, Y., Chen, F., Djekidel, M. N., ... & Gao, J. (2018). Alterations of specific chromatin conformation affect ATRA-induced leukemia cell differentiation. Cell death & disease, 9(2), 200. (IF: 9.696)

11. Wang, J., Chen, F., Liu, L., Qi, C., Wang, B., Yan, X., ... & Du, Y. (2016). Engineering EMT using 3D micro-scaffold to promote hepatic functions for drug hepatotoxicity evaluation. Biomaterials, 91, 11-22. (IF: 15.304)

承担课题

国家自然科学基金面上项目（31871343），1Kb分辨率Hi-C数据分析框架搭建及其在人干细胞肝向分化研究中的应用，2019.01至2022.12，参与。

专利情况

陈阳，陈凤玲，李贵鹏，张奇伟；一种染色质拓扑结构域边界的分析方法 (专利号：ZL201810890699.1)